Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB4Q9NTQ9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms