Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATG3Q9NT62 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG3Q9NT62 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms