Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT82Q9NSB4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms