Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms