Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms