Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP29Q9HBJ7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms