Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 RRP1-201ENST00000467112 3019 ntTSL 1 (best)13.92□□□□□ -0.182e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 CTBP1-213ENST00000514210 856 ntTSL 213.91□□□□□ -0.182e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 AGAP3-221ENST00000490097 604 ntTSL 414.03□□□□□ -0.166e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.184e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 NOL4L-204ENST00000375677 541 ntTSL 311.04□□□□□ -0.644e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.146e-8■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 CDK19-208ENST00000497709 1117 ntTSL 314.44□□□□□ -0.16e-8■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 CDK19-201ENST00000323817 6067 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.076e-8■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.329e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 PIP5K1C-204ENST00000587482 1311 ntTSL 515.21■□□□□ 0.039e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.229e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.691e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 CREB1-204ENST00000421139 713 ntTSL 516.32■□□□□ 0.21e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 CREB1-206ENST00000432329 7650 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.831e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 CREB1-201ENST00000353267 7588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.051e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 CREB1-216ENST00000494094 580 ntTSL 26.01□□□□□ -1.451e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 CREB1-211ENST00000452474 518 ntTSL 46.01□□□□□ -1.451e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 CREB1-207ENST00000445803 651 ntTSL 44.36□□□□□ -1.711e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 AIG1-204ENST00000367601 727 ntTSL 511.92□□□□□ -0.54e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 AIG1-205ENST00000447498 444 ntTSL 511.4□□□□□ -0.584e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 AIG1-201ENST00000275235 1202 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.894e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 AIG1-202ENST00000357847 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.984e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.34e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.554e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 URI1-206ENST00000574110 2495 ntTSL 1 (best)22.65■■□□□ 1.227e-11■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.367e-11■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.183e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 CD63-211ENST00000551173 788 ntTSL 318.61■□□□□ 0.573e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 CD63-213ENST00000552164 845 ntTSL 218.46■□□□□ 0.553e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 CD63-209ENST00000550050 829 ntTSL 514.73□□□□□ -0.053e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.133e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 CD63-203ENST00000546457 607 ntTSL 212.97□□□□□ -0.333e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.515e-10■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 THUMPD3-AS1-209ENST00000518437 240 ntTSL 216.52■□□□□ 0.242e-10■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.282e-10■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 THUMPD3-AS1-203ENST00000469846 670 ntTSL 310.88□□□□□ -0.672e-10■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 THUMPD3-AS1-205ENST00000481221 683 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.132e-10■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 THUMPD3-AS1-201ENST00000467069 667 ntTSL 57.56□□□□□ -1.22e-10■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.22e-10■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.542e-10■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 THUMPD3-AS1-218ENST00000522525 1867 ntTSL 1 (best)4.86□□□□□ -1.632e-10■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 THUMPD3-AS1-207ENST00000494680 544 ntTSL 54.08□□□□□ -1.762e-10■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 THUMPD3-AS1-216ENST00000521708 549 ntTSL 33.75□□□□□ -1.812e-10■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 CERS4-207ENST00000558877 758 ntTSL 312.57□□□□□ -0.44e-8■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 C1QTNF6-207ENST00000497071 688 ntTSL 311.44□□□□□ -0.581e-8■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.236e-12■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 NCOA2-202ENST00000518287 6087 ntTSL 56.78□□□□□ -1.321e-11■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 GPR89B-203ENST00000468618 750 ntTSL 315.11■□□□□ 0.016e-10■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 GPR89B-205ENST00000488165 1954 ntTSL 1 (best)14.96□□□□□ -0.016e-10■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.086e-10■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 GPR89B-204ENST00000478307 2633 ntTSL 214.32□□□□□ -0.126e-10■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 BRD4-205ENST00000594841 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.39□□□□□ -0.274e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 BRD4-210ENST00000601941 604 ntTSL 510.95□□□□□ -0.664e-7■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 MBD3-211ENST00000592965 568 ntTSL 421.94■■□□□ 1.18e-8■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 MBD3-204ENST00000585967 583 ntTSL 416.17■□□□□ 0.188e-8■■■■□ 21.2
CSTF2TQ9H0L4 HUWE1-205ENST00000446750 872 ntTSL 519.4■□□□□ 0.74e-9■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 HUWE1-201ENST00000218328 5488 ntTSL 516.92■□□□□ 0.34e-9■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.794e-9■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.344e-9■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 TRIP12-215ENST00000479037 2938 ntTSL 1 (best)13.84□□□□□ -0.196e-10■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 TRIP12-209ENST00000435716 603 ntTSL 37.64□□□□□ -1.196e-10■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.346e-10■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.262e-8■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.296e-7■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.089e-7■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.589e-7■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.535e-7■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.475e-7■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 AGAP3-209ENST00000469901 582 ntTSL 318.74■□□□□ 0.595e-7■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 NFE2L1-206ENST00000577431 583 ntTSL 516.87■□□□□ 0.291e-6■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.161e-7■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 EPHA2-204ENST00000480202 795 ntTSL 516.81■□□□□ 0.285e-6■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 RELT-206ENST00000545687 586 ntTSL 421.21■□□□□ 0.991e-6■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 CARD9-203ENST00000460290 1061 ntTSL 323.52■■□□□ 1.367e-8■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 MADD-221ENST00000526603 534 ntTSL 422.31■■□□□ 1.164e-6■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 CRTC2-201ENST00000303569 2290 ntTSL 520.26■□□□□ 0.831e-7■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.824e-6■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.811e-7■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.72e-6■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.594e-6■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.564e-6■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 CC2D1A-204ENST00000587508 1667 ntTSL 518.06■□□□□ 0.484e-6■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.444e-6■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 CTSB-206ENST00000524500 573 ntTSL 417.77■□□□□ 0.444e-6■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 CTSB-233ENST00000534636 633 ntTSL 417.52■□□□□ 0.44e-6■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 FGF17-203ENST00000521709 799 ntTSL 317.51■□□□□ 0.394e-6■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 CARD9-206ENST00000489932 1912 ntTSL 517.46■□□□□ 0.397e-8■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.387e-8■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 JUP-212ENST00000591690 583 ntTSL 317.39■□□□□ 0.374e-6■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 MADD-213ENST00000444117 711 ntTSL 317.19■□□□□ 0.344e-6■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 CPLX1-202ENST00000504062 497 ntTSL 317.16■□□□□ 0.344e-6■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.37e-8■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.274e-6■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 CARD9-204ENST00000481053 4060 ntTSL 216.31■□□□□ 0.27e-8■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 CTSB-226ENST00000532656 573 ntTSL 416.31■□□□□ 0.24e-6■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.24e-6■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 CTSB-222ENST00000531551 1855 ntTSL 1 (best)16.22■□□□□ 0.194e-6■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.184e-7■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.164e-6■■■■□ 21.1
CSTF2TQ9H0L4 RNF2-204ENST00000498201 631 ntTSL 216.07■□□□□ 0.164e-7■■■■□ 21.1
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