Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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HOXD1Q9GZZ0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD1Q9GZZ0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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