Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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FOXQ1Q9C009 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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FOXQ1Q9C009 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXQ1Q9C009 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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