Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC12A9Q9BXP2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms