Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS2Q9BXC9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BBS2Q9BXC9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BBS2Q9BXC9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms