Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
SYCP2Q9BX26 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms