Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT11Q9BT88 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT11Q9BT88 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms