Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GINS3Q9BRX5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GINS3Q9BRX5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms