Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIOK1Q9BRS2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RIOK1Q9BRS2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms