Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF559Q9BR84 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms