Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms