Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms