Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YME1L1Q96TA2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms