Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UIMC1Q96RL1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms