Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms