Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCMTD1Q96MG8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms