Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC138Q96M89 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC138Q96M89 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms