Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPGRIP1Q96KN7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms