Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUNDC1Q96C34 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RUNDC1Q96C34 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms