Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC33■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PRG4Q92954 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms