Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF4BQ92750 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms