Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GATAD2BQ8WXI9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATAD2BQ8WXI9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms