Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms