Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms