Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HJURPQ8NCD3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms