Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNBD1Q8NA66 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNBD1Q8NA66 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms