Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms