Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CA13Q8N1Q1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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CA13Q8N1Q1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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CA13Q8N1Q1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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CA13Q8N1Q1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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CA13Q8N1Q1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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CA13Q8N1Q1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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CA13Q8N1Q1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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CA13Q8N1Q1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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CA13Q8N1Q1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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CA13Q8N1Q1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA13Q8N1Q1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
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