Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACE1Q8IYU2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms