Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC170Q8IYT3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms