Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC83Q8IWF9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms