Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.32■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.32■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.31■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.3■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.29■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.27■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.27■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.27■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STRADAQ7RTN6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms