Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms