Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
LRRC9Q6ZRR7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LRRC9Q6ZRR7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms