Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRIG3Q6UXM1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms