Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC171Q6TFL3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms