Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUSD4Q5VX71 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms