Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.3■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OTUD1Q5VV17 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OTUD1Q5VV17 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OTUD1Q5VV17 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OTUD1Q5VV17 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OTUD1Q5VV17 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD1Q5VV17 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD1Q5VV17 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD1Q5VV17 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD1Q5VV17 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD1Q5VV17 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms