Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4DIPQ5VU43 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DIPQ5VU43 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms