Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF20Q5VTR2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF20Q5VTR2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms