Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
BEND3Q5T5X7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEND3Q5T5X7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms