Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC3LQ5T215 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms