Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP188Q5SRE5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP188Q5SRE5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms