Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRMS1LQ5PSV4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms